名前：加持リョウジ（かじ りょうじ）
生年月日：1985年6月17日
身長：不明
血液型：A型
所属：NERV特殊監査部所諜報員
声優：山寺宏一

葛城ミサトや赤城リツコの友人であり、NERVの諜報員。色気のあるキャラクターで、かなりの女好きとしても知られています。その一方で非常に謎も多く、ゼーレの一員として碇ゲンドウを監視していたり、日本政府内務省の諜報員としても活動しています。

名前：葛城 ミサト（かつらぎ ミサト）
生年月日：1986年12月8日
身長：163㎝
血液型：AO型
所属：NERV戦術作戦部作戦局第一課 課長
声優：三石琴乃

葛城ミサトはNERVの戦術作戦部作戦局第一課で活動していて、シンジがEVAのパイロットになってからは彼の保護者となっています。のちにアスカも加わります。新劇場版では反NERV組織「WILLE（ヴィレ）」の中心人物となっていて、明るい性格は冷淡にものへと変わりました。

名前：真希波・マリ・イラストリアス（まきなみ・まり・いらすとりあす）
生年月日：1998年3月31日
身長：172㎝
血液型：不明
所属：EVA仮設5号機・2号機・8号機操縦者
声優：坂本真綾

マリは新劇場版から登場したキャラクターで、初回は仮設5号機のパイロットとして登場しました。その後は2号機にも乗り、最終的に8号機のパイロットになりました。また、彼女は漫画版のほうにも登場していたようで、当初はシンジの母親碇ユイに恋心を寄せる少女として描かれていました。

名前：碇 シンジ（いかり しんじ）
生年月日：2001年6月6日
身長：157㎝
血液型：A型
所属：NERV、EVA初号機専属操縦者
声優：緒方恵美

碇シンジはEVA初号機に乗るパイロットで、同作品の主人公です。父親はNERVの司令官の碇ゲンドウで、母親は綾波レイの元にもなった碇ユイ。突如としてEVA初号機に乗ることになった碇シンジは様々な使徒と戦い、数多くの人たちと出会い、成長を重ねていきます。サードインパクトの元凶になった際には絶望に苛まれてしまいました。

名前：渚 カヲル（なぎさ かをる）
生年月日：2000年9月13日
身長：162㎝
血液型：不明
所属：NERV、ゼーレ
声優：石田彰

渚カヲルは1995年から放送されたテレビアニメ版と新劇場版とでは少し違い、テレビアニメ版では第17使徒タブリスとして描かれ、新劇場版ではEVA第13号機のパイロットとしてシンジとともに戦う少年として描かれています。どちらにしてもシンジに大きな影響を与えたのは間違いなく、登場シーンは少ないものの絶大な人気を集めています。

名前：綾波 レイ（あやなみ れい）
生年月日：不明
身長：不明
血液型：不明
所属：NERV、EVA零号機専属操縦者
声優：林原めぐみ

物語序盤から登場するヒロインの1人。無表情で感情を表に出すことが無いものの、シンジと出会ったことで徐々に自我が芽生えていきます。シンジの母親の遺伝子を持っていて、多くのクローンが存在することでも知られています。そのため、クローンも登場していて、クローンは「アヤナミシリーズ」と呼ばれています。

名前：惣流・アスカ・ラングレー（そうりゅう・あすか・らんぐれー）
生年月日：2001年12月4日
身長：157㎝
血液型：A型
所属：NERV、EVA弐号機専属操縦者
声優：宮村優子

「あんたバカァ？」のフレーズでもお馴染みの人気キャラクター。作品の中ではエリートとして知られていて、パイロットとして優れた能力を持っています。幼少期の頃からエヴァンゲリオンの操縦者として見いだされて英才教育を受け、14歳にして大学も卒業しています。