加藤玲奈の学歴については高校も同様に何も明かされていないため、ほとんど情報はありません。ですが、AKB48としての活動があることを考えると通っていたのはおそらく通信制の高校ではないかと思われます。また、彼女の通っていた高校については東京にある通信制の「ルネサンス高校」とも言われていますが、とくに根拠などはないようです。

加藤玲奈は高校を卒業したあと進学した大学について「明星大学」、「大妻女子大学」といった名前がネット上で噂となりました。ただ、これについては同姓同名の人物がたまたまその大学に通っていたということがわかっていて、彼女が通っていた大学については詳しい情報などはありません。

加藤玲奈の進学した大学については様々な憶測が流れましたが、彼女自身大学には進学していないものと思われます。これについては特に進学に関するものや大学生活について関する発言などがないことが要因となっていて、現在はAKB48一本で活躍しているものと思われます。